En el año 2199 la humanidad se encuentra al borde de la extinción luego de que el Imperio Gamilas bombardeara la Tierra con armas radiactivas que transformaron la superficie del planeta en un lugar inhabitable. Los últimos sobrevivientes viven refugiados bajo tierra mientras la contaminación continúa expandiéndose y el tiempo para salvar a la raza humana se agota rápidamente. Cuando todo parece perdido, un mensaje proveniente del distante planeta Iscandar ofrece una última esperanza: una tecnología llamada Cosmo Cleaner D capaz de purificar la Tierra y restaurar la vida. Para alcanzar ese mundo ubicado a más de 148.000 años luz y regresar antes de que la humanidad desaparezca, la Fuerza de Defensa Terrestre reconstruye el histórico acorazado Yamato como una poderosa nave espacial equipada con tecnología avanzada. Bajo el mando del Capitán Juzo Okita, la tripulación emprende un peligroso viaje interestelar enfrentando flotas alienígenas, fenómenos cósmicos, sacrificios constantes y el desgaste emocional provocado por una guerra desesperada. Entre ellos destaca Susumu Kodai, un joven oficial marcado por la pérdida y el odio hacia Gamilas, cuyo recorrido terminará convirtiéndose en una historia de madurez, compañerismo y esperanza. A lo largo de su travesía, Yamato mezcla aventura espacial, drama humano y conflictos bélicos en una obra que transformó para siempre la ciencia ficción japonesa y dejó una huella histórica en el anime.