Segunda temporada de Soukyuu no Fafner que tiene lugar dos años y medio después de los acontecimientos narrados en la película Soukyuu no Fafner: Heaven and Earth. Lejos de haber terminado con la amenaza de los Festum, la isla Tatsumiya sigue estando en peligro tanto por parte de los invasores como de la propia huma...

El éxodo de Kazuki y Soushi continúa fuera de la isla Tatsumiya buscando la forma de comunicarse con el nuevo Mir antes de que ocurra la tragedia que se prevee. Mientras tanto, en la isla, la nueva generación de pilotos la defiende con uñas y dientes del asedio de los Festum y comienzan a sufrir las consecuencias d...