El padre de Netto, Yuuichirou Hikari, ha logrado un gran avance científico con la introducción de los «chips sincrónicos». Si un operador y su navi se encuentran en un entorno especial conocido como «área dimensional», ¡pueden fusionarse en el mundo real mediante una técnica llamada «fusión cruzada»! El primer sujeto de prueba de Yuuichirou, Misaki Gorou, intenta el proceso y, lamentablemente, fracasa. Netto se ofrece a intentarlo con Rockman, pero su padre se lo prohíbe. La fusión cruzada supone un enorme esfuerzo para la salud del operador, y luchar en el mundo real podría significar la muerte.